Biyoinformatiğin Önemi

Mikrobiyoloji, uzun yıllardır biyoinformatikten yaygın olarak faydalanmakta ve biyoinformatik analizleri de dahil olmak üzere mikrobiyolojik çalışmaların temelini oluşturmaya başlamıştır. Özellikle bakteri/viral/mantar genomik çalışmalarında yüksek verimli veriler üreten dizileme sistemlerinin kullanılması, elde edilen verilerin mikrobiyologlar tarafından biyoinformatik olarak değerlendirilmesine olanak tanır, ancak bu analitik süreçleri yürütmek için özel beceriler gereklidir. .

Bu Çalışmanın Amacı

Bu çalışmada, mikrobiyolojik genomik verileri analiz etmeyi planlayan mikrobiyologlar için günlük kullanım için bir giriş eğitim paketi geliştirdik. Eğitim içeriğinin biyoinformatik alanında bir ekosistem kurulmasını hızlandıracağı ve gelecekte yapılabilecek kapsamlı projeler yardımıyla yapılacak proje ve çalışmalara hız kazandıracağı düşünülmektedir.Bilgisayar bilimi altyapısına sahip olmayan bu araştırmacıların ihtiyaçları doğrultusunda hazırlanan bu eğitim paketi, bu alanda çalışmak isteyenlerin her an kolayca takip edip erişebilecekleri bir platform olan GitHub'da da yayınlanacaktır

Dizileme Platformları

DNA dizilemesi, bir DNA molekülündeki nükleotit bazlarının (adenin, guanin, sitozin ve timin) sırasının belirlenmesidir. DNA dizilerinin bilinmesi temel biyoloji, biyoteknoloji, adli bilim, tıbbi tanı koyma gibi pek çok sahada vazgeçilmez hâle gelmiştir. DNA dizilemesi biyolojik araştırma ve keşifleri çok hızlandırmıştır. Modern DNA dizileme teknolojilerin mümkün kıldığı hızlı DNA dizileme sayesinde İnsan Genom Projesi'nde insan genomunun dizilenebilmiştir. Benzer projelerle pek çok hayvan, bitki ve mikrop genomunun tam dizisi üretilebilmiştir.

Veri Görselleştirme

Veri görselleştirme; verileri insan beyninin anlaması ve içgörü alması için, daha kolay hale getirmek üzere grafik gibi görsel bir bağlama çevirme uygulamasıdır. Grafiklerde bulunan verileri, görsel nesneler (noktalar, çizgiler veya çubuklar) olarak kodlayarak anlaşılır kılmak için kullanılan teknikleri ifade eder. Veri görselleştirme, bilgi ve verilerin grafiksel temsilidir. Grafikler ve haritalar gibi görsel ögeleri kullanan veri görselleştirme araçları; verilerdeki eğilimleri, aykırı değerleri görmeyi sağlar. Bu şekilde genomik verilerden anlamlı sonuçlar çıkarılabilmektedir.